L'étude a révélé que les souches du virus peuvent être divisées en trois types : A, B et C. Bien que la version la plus originale, le « type A », soit apparue à Wuhan, les souches mutées du « type B » étaient plus courantes dans les échantillons de Wuhan. Les souches de type A sont plus courantes dans les échantillons de recherche provenant des États-Unis et d'Australie.

Selon un rapport de la Deutsche Welle du 11, le rapport de recherche intitulé « Analyse du réseau phylogénétique des génomes du SARS-CoV-2 » a été co-écrit par des chercheurs britanniques et allemands et publié dans les Actes de l'Académie nationale des sciences des États-Unis (PNAS) le 8 avril. Les chercheurs ont utilisé la technologie des réseaux génétiques pour cartographier la « voie évolutive » précoce du nouveau coronavirus dans le corps humain. L’étude a analysé les 160 premiers génomes viraux complets obtenus auprès de patients et a identifié différentes lignées virales du nouveau coronavirus produites par des mutations.

Peter Forster, généticien à l'Université de Cambridge et auteur principal du rapport, a déclaré qu'en raison du nombre trop élevé de mutations rapides du virus, les chercheurs ne peuvent pas retracer entièrement la lignée familiale du virus. Ils utilisent donc des algorithmes de réseau mathématique pour trouver toutes les lignées possibles en même temps. Foster a déclaré que l’utilisation la plus connue de cette technologie est le suivi des mouvements des humains préhistoriques grâce à l’ADN. « Je pense que c’est la première fois que ce procédé est utilisé pour retracer le cheminement de l’infection d’un coronavirus comme celui-ci. »

L'équipe de recherche a extrait 160 échantillons collectés entre le 24 décembre 2019 et le 4 mars 2020 de la base de données de l'Initiative mondiale pour le partage de toutes les données sur la grippe (GISAID) et a trouvé trois types de nouveaux coronavirus avec des lignées génétiques proches, qui ont été divisés en types A, B et C. La souche la plus primitive, de type A, est la plus proche de la souche trouvée chez les chauves-souris. Bien que le type A soit également apparu à Wuhan, il ne s’agit pas de la souche la plus courante à Wuhan.

L’étude a souligné que ce type de souche a également été retrouvé chez les Américains ayant vécu à Wuhan. L’étude a révélé que le type A est plus fréquemment trouvé chez les personnes infectées aux États-Unis et en Australie, tandis que le type B, une souche mutée du type A, est plus courant à Wuhan.

Dans l’ensemble, le type B est plus courant en Asie de l’Est et est moins susceptible de se propager à d’autres régions sans muter, indique le rapport. Les chercheurs ont analysé que la raison pourrait être l'« effet fondateur » génétique de Wuhan, ou que les personnes en dehors de l'Asie de l'Est sont plus résistantes à ce type de souche.

Le type C, issu d'une mutation du type B, apparaît principalement en Europe et peut être détecté chez les premiers patients en France, en Italie, en Suède et au Royaume-Uni. Bien que le type C n’ait pas été détecté dans les échantillons de patients chinois participant à l’étude, il a été détecté à Singapour, à Hong Kong et en Corée du Sud.

En fait, au premier stade de l’épidémie, les types A et C étaient les plus courants dans les régions situées hors de l’Asie de l’Est, comme l’Europe, les États-Unis et l’Australie. Le type B est le plus courant en Asie de l’Est. Le type C est apparu pour la première fois à Singapour et était également la souche communément trouvée chez le premier groupe de personnes infectées en Europe.