Le suspect a été identifié et rendu public comme étant Mickaël Harpon, un administrateur informatique de 45 ans travaillant pour la direction des renseignements de la préfecture de police de Paris. Selon un article du Parisien qui cite des informations publiques de la police, Michel Harpen est originaire de la Martinique et expert en informatique. Il a rejoint en 2003 la très sensible Direction du Renseignement de la Préfecture de Police de Paris et s'est principalement consacré à la lutte contre le terrorisme. . Il a épousé sa femme Iham en 2014 et ils ont une fille de 9 ans et un garçon de 3 ans.
Le Parquet national antiterroriste a annoncé le 4 juillet qu'il mènerait l'enquête sur l'attentat, l'objectif étant de confirmer des « faits d'homicides sur agents des forces de l'ordre en lien avec des organisations terroristes » et des « associations de malfaiteurs terroristes ». . Les médias français estiment généralement qu'il s'agit là d'un tournant majeur dans l'enquête.
Les enquêteurs ont récupéré des informations sur l'ordinateur et le téléphone portable du suspect pour tenter de trouver de nouveaux indices. Ils ont également continué à interroger l'épouse du suspect et d'autres témoins pertinents, et ont découvert plusieurs « éléments de preuve » qui pourraient être liés au terrorisme.
Les premières enquêtes ont révélé que le suspect souffrait de troubles de l'audition et de la parole et qu'il était apparemment « frustré » de ne pas avoir été promu. Il a également été découvert qu’il s’était converti à l’islam il y a 18 mois. Les perquisitions effectuées à son domicile n'ont pas permis de trouver de preuve qu'il se soit converti à l'extrémisme religieux, mais des informations sur le téléphone et l'ordinateur du suspect suggèrent qu'il pourrait avoir des liens avec des groupes terroristes.
L'épouse du suspect a déclaré aux enquêteurs que son mari s'était comporté de manière étrange la veille de l'attaque. Cependant, comme l'épouse du suspect souffre également de troubles de l'audition et de la parole et a des difficultés à communiquer, les enquêteurs ne peuvent communiquer avec elle que par le biais du langage des signes, et l'enquête progresse lentement.
Au fur et à mesure que l'enquête se déroulait, davantage de détails sur l'identité du meurtrier ont été progressivement révélés. Les voisins de Harpen ont été choqués lorsqu'ils ont été interrogés, affirmant que Miguel avait une personnalité paisible et faisait généralement le ménage. Un voisin a déclaré qu'il l'avait rencontré ce matin-là et qu'il n'avait rien remarqué d'inhabituel.
Les enquêtes ont également révélé que le suspect était considéré comme un membre de confiance du personnel du siège de la police et qu'il disposait d'une habilitation de sécurité de haut niveau au sein du siège de la police. Des témoins de l'incident ont déclaré que le suspect travaillait dans une zone sécurisée du bâtiment et pouvait se déplacer librement dans le bâtiment car il disposait d'une habilitation de sécurité. Harpen se disputait avec colère avec quelqu'un et a soudainement sorti un couteau en céramique pour attaquer ses collègues. Il a d'abord poignardé trois personnes dans le bureau des renseignements où il travaillait, puis a étendu la portée de l'attaque à d'autres personnes.
Il a été rapporté que lorsque Harpen est arrivé dans la cour, d'autres policiers lui ont ordonné à plusieurs reprises de déposer son arme, mais en vain. Un policier du service de l'ordre public et de la circulation a tiré deux coups de feu, atteignant Harpen à la tête et le tuant.
Le siège de la police est situé dans le quartier touristique de l'Île de la Cité, à quelques pas de Notre-Dame. Après l'attaque contre les policiers, les autorités ont fermé la station de métro Cité et ont partiellement bloqué les environs. Le président Macron, le Premier ministre Philippe et le ministre de l'Intérieur Castaner ont annulé leurs plans initiaux et se sont précipités sur les lieux de l'incident pour exprimer leur soutien et leur solidarité avec les forces de l'ordre.
Depuis les attentats terroristes qui ont choqué le monde en 2015, la police française est fréquemment attaquée par des extrémistes et subit une énorme pression mentale en raison de la vague de manifestations violentes qui secoue le pays depuis près d'un an. De nombreux officiers ont accumulé des centaines d’heures supplémentaires et leurs corps ont été poussés à leurs limites.
Le mauvais environnement de travail des policiers est également à l’origine du taux de suicide de plus en plus élevé parmi eux. Selon les données du ministère de l'Intérieur, 48 policiers se sont suicidés au cours des quatre premiers mois de cette année, dépassant de loin les 35 policiers qui se sont suicidés au cours de toute l'année 2018. En outre, 12 gendarmes et 17 pompiers se sont suicidés. .
Le ministre de l'Intérieur Castaner a annoncé en avril la mise en place d'un dispositif de prévention du suicide au sein de la police nationale. Il a souligné que la France adopterait également des mesures globales pour répondre aux pressions et aux difficultés rencontrées par la police dans son travail et sa vie, notamment en relançant la réforme du cycle de travail et en allouant des fonds en 2020 pour augmenter les salaires des policiers. Mais évidemment, l’effet n’est pas très évident.
La veille de l'attaque contre des policiers, des dizaines de milliers de policiers étaient descendus dans la rue lors d'une « marche de colère » pour réclamer de meilleures conditions de travail, réduire la haine envers les policiers et s'opposer à la réforme du système de retraite prévue par le gouvernement. Les organisateurs ont déclaré qu'environ 27 000 policiers ont participé à l'événement.